舞台来到未来世界，夏目要出去街上看有没有被妖怪骚扰需要侦探团帮助的。コマさん-狛太郎有事要拜托夏目，先去侦探团通常的集合地点公园看看吧。
出门就遇到“怪杰超人”被一头发光的小狗吓到了，这小狗可能是コマさん-狛太郎派过来的，先跟着。
舞台来到未来世界，夏目要出去街上看有没有被妖怪骚扰需要侦探团帮助的。コマさん-狛太郎有事要拜托夏目，先去侦探团通常的集合地点公园看看吧。
跟着地图提示来到コマさん-狛太郎面前发生剧情，原来发光的小狗是コマさん-狛太郎的灵体，专门负责带路的(有时候也会找到妖怪或者宝物的隐藏地点)，在地图上按“上键”即可开启或者关闭带路功能，然后按“左键”可以指定自由指定目标地点(按Y调出地图可以标记目的地，然后按“左键”设定带路去哪个标记，这里注意将目的地设为家里，以后用得上)。
聊完小狗接着聊正事-妖怪扭蛋，本以为コマさん-狛太郎是要夏目帮忙扭蛋(其实人家用嘴巴都能将硬币放进去啦)，但其实是扭蛋机出故障了，想夏目用手表扫来看看。
扫描扭蛋机发现扭蛋机被“妖气污染”了，要解除污染状态只需要和对战中吸取对方妖气的办法一样，按住ZR将妖气吸走即可。操作方式就是按住ZR，让妖气槽接近最高点再按Y即可，操作得越好遇到的妖怪会越稀有(这里暂时妖气污染还不会攻击，但是以后需要按ZL来弹回;另外有时候故意不按ZL也可以掉进去妖气污染遇到某些特定妖怪)。
吸走扭蛋机的妖气后发现是只妖怪，破坏扭蛋机所以大家只好教训他了(“怪杰超人”自动上场)。
对战中按右手柄的小十字键可以暂停对战查看双方数据(L键我方、R键敌方)，右下角的选项分别是选定目标、调用道具、交换队员等，在这个界面还能按左手柄的“-”键来投降。
将妖怪击败后抢回扭蛋币，地缚猫就跑了，但是“怪杰超人”只想一直呆在夏目身边，接着コマさん-狛太郎讲抢回的扭蛋币送给了夏目。
接着就是扭蛋教程，每天最多只能扭蛋30次(每天随机变化总次数)，并且每次扭蛋会自动存档(不存在SL大法)，币除了购买DLC、做任务、还能在野外找到(虽然野外找到的币都很差)。
扭蛋好了经コマさん-狛太郎提醒赶紧去公园找侦探团了，但是路上遇到刚转校过来的酒吞君(转校生都有点来头)。由于他还没什么朋友所以想和夏目一起玩，但是侦探团可不能随便带人所以夏目给婉拒了。之后的对话中，维斯帕有夏目要走桃花运的预感，“怪杰超人”表示自己一直想和夏目约会(妄想)。
来到公园与侦探团其他成员会合(因为迟到被训要守时)，附近有3件怪异事件，对话中得知强力手表可以使用凭依召唤让上级妖怪变身，アキノリ手表都没有但自封为团长。接下来可以与トウマ互换来操作。
接下来开启任务模式，任务分为委托任务和剧情关键任务，与街上头顶带问号的人对话可接受委托解决事件，接受任务后长按L可以自动调出提示该任务的目的地方便找到任务目标(但是这个提示也不是万能的会受天气、时间等的影响，要注意)。
1、妹子这里有个任务，是要调查ギヨロメ男的正体，对话并接受任务后按X调出任务选项选中以后可以调出地图提示。
跟着提示来到目的地，原来コマさん-狛太郎散步途中感到墙上有奇怪的气息，夏目用手表扫了以后发现奇怪的标志，之后“怪异超人”出现，原来这个标志都是怪异超人的杰作，为了守护夏目，这家伙还在四面八方都弄了这些标志。为了不给其他人造成麻烦，要消除这些标志就必须用手表扫出来才行，接下来可以在地图上找出这种标志然后与怪异超人换取奖品。事件解决
接着发生剧情，酒吞君和洞洁对话，似乎觉得人间界太过于和平安宁，来这里几个月了，发现满大街都是低级妖怪，按这样“计划”进行应该没有问题了。跟着出现另一个妖怪フクロウ，原来他要寻找出生在人间界的公主(空手而归挨骂)，而公主留下的鬼樱花，说明鬼族的公主一定在人间等待着复活。看来低级妖怪的暴走与フクロウ使的“矢”有关。
解决完标志事件后第二天大家回到公园，接着讨论下一个怪异事件，维斯帕表示随着解决怪异事件的增加会更厉害的妖怪进行战斗的可能也在增加，所以需要更多的妖怪伙伴增强实力。这就需要“魂カツ”的服务(其实就是四代的抓怪新系统，对战中获得魂，用魂生成妖怪)，详细需要到附近的コロズマート向工作人员讨教。
跟着地图提示来到“魂カツ”的工作人员处，发生剧情。“魂カツ”是专门为妖怪提供的“将妖怪的魂进行交换”服务，为了入手魂，首先要在对战中对妖怪使用“魂スイトール”就可以获得该妖怪的魂。
接着会进行针对初学者的体验对战，再次与其对话即可。进入对战后当妖怪头上出现こんす い(有读秒，要注意把握时机)提示时，靠近妖怪按A就可以对妖怪使用“魂スイトール”，然后长按ZR进行“魂スイトール”，妖怪的魂分为白、赤、金三个等级(金为最高级)。
战斗过后夏目担心抽出魂以后妖怪是不是就死了，但是魂猴解释被抽出的魂还会复活，所以不必担心。
以后要找魂猴得去“魂カツ相谈所”找他了(按X也能调出该功能)，门出现后调查门进入可以再次遇到魂猴，这里是他原本的工作场所，与他对话后可以进行首次魂カツ(首次免费)，之后拿到魂都可以来这里花钱进行妖怪强化(还可以对道具进行强化哦)，在系统选项里也会新增魂功能按钮，另外还会入手交换按钮，利用这个可以与朋友进行魂和妖怪的交换(网络交换功能、以后再测试了)。
2、自行车事件
接着调出任务按钮，找到另外两个没解决的任务将提示调整，下一个任务与自行车妖怪有关，来到任务所在地接受任务。原来小孩遇到的自行车妖怪，会在街道上徘徊并发出“反正我是没用的自行车”“神仙让我生在自行车太对不起了”，由于看起来不恐怖的弱妖怪，小孩还想把它找出来(朋友吐槽：为啥就那么想找出妖怪呢)。虽然妖怪听起来很弱，但是为了两个小孩还是跟上去看看。
跟上小孩后为了保护他们的安全アキノリ只好骗他们在公园出现了自行车妖怪的踪影，小孩走开后就在附近找自行车妖怪的踪迹吧。
跟着提示来到自行车摆放的树下，大家一起研究自行车时谈到夏目还没有自己的自行车呢，其他人都有过自己的自行车了，闲谈完先调查自行车吧。
在自行车附近扫描到自行车妖怪，这真是个自卑的自行车怪，觉得自己与别人对话的价值都没有，对话中忽然它被黑色的东西射中就暴走了(看来是酒吞君手下的フクロウ搞鬼)，嚷着人类不能相信要杀掉夏目几个。
将其击败之后自行车怪各种道歉反省(就算再怎么憎恨人类也不应该做这样的行为等等)，原来这家伙是自行车们的怨念产物：自行车们本着为人类服务和让人类前往更远大的世界的理想却被抛弃在了树下日晒雨淋，虽然它们各种残破但是修修还能用啊，为何就~结果由此产生的欲念越来越强就暴走了，夏目忽然想到可以修理这些自行车帮助它们(入手破烂自行车两辆)。
跟着提示回到家与爸爸对话，将自行车交给爸爸维修，之前他刚修过ケースケ的自行车，画面转到门口，爸爸一会儿就修好了一台，朋友们各种夸奖并承诺和夏目是最好的伙伴，接着爸爸要休息一下交给夏目钱去买雪糕。
来到上图便利店
进入后与店员对话将四种雪糕(70-330)每种买一个即可
买完雪糕回去找爸爸，四个人将雪糕分掉吃完后继续修理自行车。爸爸修完自行车后回去屋子里了，由于アキノリ自己有自行车(借给老奶奶了)，所以这两台自行车就分给了其他俩人，自行车妖怪也加入成为伙伴。至此自行车事件解决
然后又有剧情，蛇王カイラ发现人间界有异样，似乎要发生什么大事，可能与妖怪手表持有者有关，接着前往人间界留下两个妖怪留守。
3、大家接着解决怪异事件，但是トウマ还在为不能凭依不动明王而烦恼。
第三个事件是タプタプ池的食人草事件，在タプタプ池有专门袭击男子的植物，这种植物会等人靠近才会忽然现身袭击。タプタプ池就在おうぎ公园附近，这位小哥哥在池子边走着忽然就被袭击了，由于池子比较大三个人调查会比较难，详细咨询得知原来是池子的排水口附近的树丛(栈桥一样的位置)。
来到目标草丛，眼看没什么异样(隐约可以看到一个妖怪)，但是扫描后发现妖怪(这样子真的跟想象的一模一样啊)，话不多说直接进入战斗。
将其打败后妖怪恢复原样-パックン(好可爱的样子)，原来它袭击人类是为了保护在它成为妖怪之前一直照顾它的女性(之前是食虫植物)，但是某天忽然有根黑色的箭射向那位女性，它以为黑箭是虫子直接给吃了。之后黑化，把所有靠近女性的男性都当作害虫袭击，虽然还不知道为何会有黑箭射向女性，但食人草事件总算解决了，パックン也加入成为伙伴。自称夏目的守护骑士的“怪异超人”忽然出现(还24小时守护夏目呢)，被パックン当害虫咬了一口，2333。
フクロウ回去向酒吞君报告今天还是没有找到公主的线索(原来它今天就是被侦探团阻碍了呀)，接着フクロウ请缨要去除掉夏目(酒吞君：找公主没戏，让人类消失应该能做到吧)，接着酒吞君对フクロウ进行强化后警告如果这次办不成就该消失了。
第二天大家一起研究这几个事件，似乎有些非偶然因素，正在讨论时听到一阵惨叫。
往旁边走去看到ケースケ(弟弟)，对话中得知他们遇到了可疑的影子，接下委托后继续调查吧，小孩子则让他们留在原地了。
对话中大家商量好，由マナミ引出犯人(侦探团负责保护妹子的安全)(从对话得知妹子喜欢人体模型，可能这跟学校的人体模型有关)。
接着到公园与ケースケ对话后进入剧情，果然引出一个黑影往龙见川方向跑了(这里需要进任务选项打开提示)。
跟着提示一路往前走，找到肝脏、肠、心脏，找到心脏后在附近的发现很强的妖气，用手表扫描可以找到“妖气污染”(这里按住ZR以后，要利用ZL来进行防御)。
将“妖气污染”清除后找到妖怪ジンタ(人体模型)，这家伙居然喜欢マナミ(难道人体模型就不能喜欢人吗?ジンタ问的)，为了让他告白避免一直跟着マナミ，夏目决定约上マナミ在学校前让他有机会告白。
跟着提示来到学校操场找到マナミ，对话后进入剧情，在学校待了50年的人体模型向マナミ告白，虽然觉得人体模型会说话很厉害，不过マナミ还是发了一张好人卡。收到好人卡的人体模型虽然哭不出来(没眼泪啊!)，还被黑箭射中(フクロウ本想射マナミ来着)，成了BOSS。
第一次打败BOSS后他还会继续站起来，这时トウマ的手表终于有反应了，重新进入对战后按X+A可以变身为不动明王，接下来站着削BOSS就行。
战斗后人体模型恢复原样，マナミ上前解释大概模型君喜欢的是マナミ的奶奶吧。原来当年マナミ的奶奶经常去理科室和模型说话，模型君的名字ジンくん也是奶奶给起的。经过提醒，模型君想起奶奶的事情并恢复了生气，虽然被拒绝还是挺惨的。模型君离开后マナミ表示以后还是要去理科室和模型说话(哈哈)。至此事件解决
正当大家为事件得到解决而高兴时，フクロウ出现瞬间将众人“按在地上摩擦”，还好蛇王出现救了大家。原来蛇王是继エンマ的魔王之位的现役魔王呀，维斯帕上前一顿拍马屁。自从打败鬼仙之后大家都好久没见了，这次蛇王感觉到人间界有危机所以出现，但是能拯救人间界的也只有侦探团的众人。
原来蛇王成为魔王之后，在魔界的书库找到预言书，上面记载着打败鬼王后鬼族的黑影笼罩人间，黑影的怨念令日月无光，使世界堕入无尽的深渊;而夺回世界之光明的是从门里出来被选中的使用魔导镜的守护者;守护者和妖魔的羁绊使得世界充满光明。在大灾难没发生前蛇王聚集伙伴肯定能对抗邪恶，因此侦探团会在蛇王的全力协助下拯救世界。首先要找出剩余的伙伴，使用新的传说的手表的话应该能找到新的伙伴，总而言之先向门出发吧(猜测是夏目的爸爸，至于预言为何意还要见到主角才能知道)。